MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori F32 plasmid pHPF32

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017370	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
2	NC_017370	A	6	6	145	150	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
3	NC_017370	TTTA	2	8	184	191	25 %	75 %	0 %	0 %	386262356
4	NC_017370	CAA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
5	NC_017370	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
6	NC_017370	AATAC	2	10	471	480	60 %	20 %	0 %	20 %	386262356
7	NC_017370	AAAAG	2	10	484	493	80 %	0 %	20 %	0 %	386262356
8	NC_017370	GAA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
9	NC_017370	ACA	2	6	573	578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
10	NC_017370	TCAA	2	8	638	645	50 %	25 %	0 %	25 %	386262356
11	NC_017370	TGT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262356
12	NC_017370	AT	3	6	686	691	50 %	50 %	0 %	0 %	386262356
13	NC_017370	CCA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386262356
14	NC_017370	A	6	6	802	807	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
15	NC_017370	TCA	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262356
16	NC_017370	ATC	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262356
17	NC_017370	GCAT	2	8	1007	1014	25 %	25 %	25 %	25 %	386262356
18	NC_017370	AAG	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
19	NC_017370	AGA	2	6	1059	1064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
20	NC_017370	A	7	7	1080	1086	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
21	NC_017370	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
22	NC_017370	CATG	2	8	1134	1141	25 %	25 %	25 %	25 %	386262356
23	NC_017370	A	7	7	1151	1157	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
24	NC_017370	A	7	7	1243	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
25	NC_017370	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
26	NC_017370	ACA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
27	NC_017370	A	6	6	1307	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
28	NC_017370	AAG	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
29	NC_017370	CAA	2	6	1344	1349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
30	NC_017370	AAG	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
31	NC_017370	T	7	7	1380	1386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017370	A	7	7	1406	1412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017370	A	7	7	1421	1427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017370	T	6	6	1502	1507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017370	T	7	7	1567	1573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017370	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017370	T	6	6	1604	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017370	GTT	2	6	1611	1616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017370	T	6	6	1615	1620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017370	TCTT	2	8	1623	1630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017370	T	6	6	1650	1655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017370	T	7	7	1688	1694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017370	A	6	6	1739	1744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017370	A	6	6	1757	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017370	T	6	6	1782	1787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017370	GAAA	2	8	1802	1809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017370	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017370	TGAC	2	8	1818	1825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017370	A	6	6	1833	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017370	TCAA	2	8	1841	1848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017370	CTGA	2	8	1850	1857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017370	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017370	CTAA	2	8	1905	1912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017370	AATCT	2	10	1948	1957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017370	CTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017370	A	6	6	2166	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017370	TAA	2	6	2217	2222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017370	TTA	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017370	AG	3	6	2298	2303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017370	AG	3	6	2363	2368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017370	A	8	8	2381	2388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017370	AG	3	6	2396	2401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017370	TAT	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017370	T	6	6	2423	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017370	TAA	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017370	T	6	6	2469	2474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017370	TGGG	2	8	2514	2521	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017370	GTGG	2	8	2529	2536	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017370	AGG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017370	CACTA	2	10	2616	2625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.